Tras el fallecimiento de don Federico Algarra Ramírez, en 1963, la emisora sufre un periodo de incertidumbre, superado con la definitiva asociación a la Cadena SER.
Esto permitirá, con los años, llegar a la actual estructura empresarial de Algarra S.A.
En esta segunda etapa, Radio Córdoba tuvo que aprender a hacer un hueco a la competencia y adaptarse a las nuevas circunstancias. Lejos de retroceder y adoptar una política conservadora, Federico Algarra Añón apostó por la ampliación y la inversión.
No han sido años exentos de esfuerzo y sacrificio, máxime cuando la competencia más fuerte se ha compuesto, fundamentalmente, de grandes empresas radiofónicas de carácter nacional, a las que una empresa familiar cordobesa debía plantar cara y superar, aún con el handicap de no tener un respaldo de capital tan fuerte como sus competidores y teniendo que someterse a permanentes inversiones técnicas para actualizar sus equipos.